تهدف المؤسسة الأوروبية العربية للدراسات العليا إلى تعزيز العلاقات الثقافية والاقتصادية بين أوروبا والعالم العربي.
فتحقيقًا لهذا الهدف، تسعى المؤسسة إلى نشرالمعرفة العلمية والإنسانية التي تنشأ من الجامعات ومراكز البحث العلمي أو الإبداع الفني، سواء في إسبانيا أو في دول أخرى. وكما تهدف من خلال ذلك إلى المساهمة في تعزيز الحوار بين الدول العربية والدول الأعضاء في الاتحاد الأوروبي، وذلك بتحفيز الدراسات والأبحاث، وإنشاء منصات ومنتديات للعرض والنقاش والحوار.
يشكل الجانب التعليمي أحد الأركان الأساسية في عمل المؤسسة الأوروبية العربية للدراسات العليا، كما تنص أنظمتها القانونية. فقد تهدف المؤسسة إلى المساهمة في تدريب الخبراء والبحث في مختلف مجالات المعرفة بحيث يؤدي ذلك تدريجيًا إلى تنمية البلدان التي تستهدفها أنشطتها.
وتبرز في نشاط المؤسسة العديد من الأنشطة التعليمية التي تشمل ليس فقط التدريب في الإدارة العليا، من خلال الدورات والدبلومات العليا، ولكن أيضًا الفعاليات التعليمية مثل المؤتمرات والندوات وورش العمل للكبار والأطفال.